محل اتصال آمینواسید: ایستگاه بارگیری مولکول ناقل
آرانای ناقل چیست و چه شکلی است؟
برای درک محل اتصال، اول باید با خود مولکول tRNA آشنا شویم. تصور کنید یک کارخانهٔ تولید پروتئین داریم. دستورالعمل ساخت پروتئینها روی DNA۶ در هستهٔ سلول نوشته شده است. این دستورالعمل ابتدا به mRNA۷ رونویسی میشود و سپس به سیتوپلاسم سلول میرود. حالا نوبت tRNA است که مانند یک کامیون حملونقل، مصالح ساختمانی یعنی اسیدهای آمینه۸ را به خط مونتاژ (ریبوزوم۹) برساند.
ساختار این مولکول بسیار جالب است و به شکل یک شبدر سهبرگ میباشد. هر یک از این برگها عملکرد خاص خود را دارند.
نام بخش | توضیح عملکرد |
---|---|
بازوی آنتیکدون۱۰ | مانند یک بارکدخوان عمل میکند و توالی mRNA را میخواند. |
بازوی TΨC | به چسبیدن tRNA به ریبوزوم کمک میکند. |
بازوی DHU | محل تشخیص توسط آنزیمهای مخصوص است. |
محل اتصال آمینواسید (بازوی پذیرنده) | مهمترین بخش؛ همان ایستگاه بارگیری است که اسید آمینه به آن متصل میشود. |
محل اتصال آمینواسید: یک سکوی اختصاصی
محل اتصال آمینواسید، که به آن بازوی پذیرنده۱۱ نیز میگویند، در واقع یک سر آزاد از مولکول tRNA است. این بخش همیشه از سه نوکلئوتید۱۲ تشکیل شده که توالی آن برای همهٔ مولکولهای tRNA یکسان است: $CCA$. این توالی ثابت، مانند یک دکمهٔ همگانی عمل میکند که آنزیمهای بارکننده میتوانند هر اسید آمینهای را به آن متصل کنند.
این ترکیب، aminoacyl-tRNA۱۳ نام دارد و شکل فعال و "بارشده" tRNA است.
مراحل بارگیری یک کامیون مولکولی
اتصال اسید آمینه به tRNA یک فرآیند دقیق و پرانرژی است که به آن بارگیری۱۴ میگویند. این کار توسط خانوادهای از آنزیمهای بسیار هوشمند به نام آمینواسیل-تیآرانای سنتتاز۱۵ انجام میشود. این آنزیم دو کار بسیار مهم را انجام میدهد:
- شناسایی اسید آمینهٔ صحیح: مانند یک کنترلکیف، فقط اسید آمینهٔ درست را انتخاب میکند.
- شناسایی tRNA متناظر: مطمئن میشود که این اسید آمینه به tRNA درست متصل شود. این اصل صحت نام دارد.
این آنزیم با استفاده از انرژی ATP۱۶، یک پیوند پرانرژی بین اسید آمینه و انتهای CCA محل اتصال ایجاد میکند. حالا tRNA بارگیری شده و آماده است تا به سمت ریبوزوم برود.
یک مثال از خط مونتاژ پروتئین
فرض کنید میخواهیم یک پروتئین بسیار کوچک با توالی لوسین-آرژینین-والین بسازیم. mRNA حاوی کدونهای $UUA$ (برای لوسین)، $AGA$ (برای آرژینین) و $GUA$ (برای والین) است.
- سه مولکول tRNA مختلف، هر کدام با آنتیکدون مخصوص خود ($AAU$، $UCU$ و $CAU$)، توسط آنزیمهای مربوطه بارگیری میشوند. یعنی اسید آمینهٔ صحیح به محل اتصال آمینواسید هر یک متصل میگردد.
- این tRNAهای بارشده به ترتیب وارد ریبوزوم میشوند و آنتیکدون آنها با کدون متناظر روی mRNA جفت میشود.
- ریبوزوم اسیدهای آمینه را از محل اتصال آنها جدا کرده و به هم پیوند میدهد تا زنجیرهٔ پروتئینی ساخته شود.
بدون وجود آن سکوی بارگیری (محل اتصال آمینواسید)، این انتقال مواد هرگز نمیتوانست به این دقت انجام شود.
اشتباهات رایج و پرسشهای مهم
خیر، این یک اشتباه رایج است. این دو بخش کاملاً مجزا و در دو سر متفاوت مولکول tRNA قرار دارند. محل اتصال آمینواسید در یک سر (بازوی پذیرنده) برای حمل بار است، در حالی که آنتیکدون در سر دیگر (بازوی آنتیکدون) برای خواندن بارکد mRNA است.
اگر آنزیم بارکننده اشتباه کند و اسید آمینهٔ نادرست را به tRNA متصل کند، یک پروتئین معیوب ساخته خواهد شد. این پروتئین ممکن است عملکرد خود را از دست بدهد و حتی باعث بیماری شود. خوشبختانه آنزیمهای بارکننده بسیار دقیق عمل میکنند و میزان خطا بسیار پایین است.
این توالی ثابت، یک الگوی استاندارد و قابل تشخیص برای همهٔ آنزیمهای بارکننده ایجاد میکند. به این ترتیب، آنزیم مجبور نیست کل ساختار پیچیدهٔ tRNA را برای اتصال اسید آمینه بررسی کند و فقط روی همین ناحیهٔ کوچک و ثابت متمرکز میشود. این کار راندمان فرآیند را بسیار افزایش میدهد.
پاورقی
۱ Amino Acid Attachment Site
۲ Transfer RNA (ناقل)
۳ Codon
۴ Anticodon
۵ Translation
۶ Deoxyribonucleic Acid
۷ Messenger RNA (پیک)
۸ Amino Acids
۹ Ribosome
۱۰ Anticodon Arm
۱۱ Acceptor Stem
۱۲ Nucleotide
۱۳ Aminoacyl-tRNA
۱۴ Charging
۱۵ Aminoacyl-tRNA Synthetase
۱۶ Adenosine Triphosphate (مولکول حامل انرژی)