یاختههای ماهیچهای از نظر موقعیت هسته تفاوتهای مشخصی دارند که با ساختار و عملکرد آنها مرتبط است. در یاختههای ماهیچهٔ اسکلتی که استوانهای شکل و منشعب هستند و چندین هسته دارند، این هستهها در حاشیهٔ یاخته و نزدیک غشا قرار گرفتهاند تا فضای مرکزی یاخته برای رشتههای انقباضی آزاد باشد. در مقابل، در ماهیچهٔ صاف که یاختههای دوکیشکل دارد و در ماهیچهٔ قلبی که یاختههای استوانهای شکل و مخطط دارد، هسته در مرکز یاخته قرار میگیرد. این تفاوت ساختاری با تعداد هستهها نیز مرتبط است؛ یاختههای اسکلتی چندین هسته دارند اما صاف و قلبی تکهستهای هستند.