بسته به محل وقوع جهش، تأثیر جهش متفاوت است. اگر جهش باعث تغییر در جایگاه فعال آنزیم شود، احتمال تغییر عملکرد آنزیم بسیار زیاد است؛ اما اگر جهش درجایی دور از جایگاه فعال رخ دهد به‌طوری‌که بر آن اثری نگذارد، احتمال تغییر در عملکرد آنزیم کم و یا حتی صفر است. در ضمن هر تغییر ژنی که منجر به تغییر عملکرد پروتئین شود، قطعاً توالی و ترتیب مونومری آنزیم را تغییر می‌دهد. بررسی سایر گزینه‌ها:

گزینه 1: چون سرعت عملکرد آنزیم افزایش‌یافته است، پس به‌احتمال‌زیاد تغییر در جایگاه فعال رخ‌داده است. اگر جهش درجایی دور از جایگاه فعال رخ دهد به‌طوری‌که بر آن اثری نگذارد، احتمال تغییر در عملکرد آنزیم کم و یا حتی صفر است.

 گزینه 2: اگر جهش باعث تغییر آمینواسیدی در جایگاه فعال آنزیم شود، هرچند توالی آمینواسیدی را تغییر داده ولی قطعاً نمی‌توان گفت که شکل فضایی آن را نیز تغییر داده است. اگر شکل فضایی جایگاه فعال تغییر کند امکان دارد عملکرد آنزیم صفر شود.

گزینه 4: لزوم افزایش سرعت آنزیم به کمک مهندسی پروتئین با پایداری آنزیم در برابر مثل گرما یا پروتئاز همراه نیست.