کتاب قرآن پایه دوم ابتدایی شامل 14 درس و 3 ایستگاه یادآوری است که هر درس ساختاری 4 جلسه‌ای دارد. برای تدریس اثربخش، لازم است زمان‌بندی جلسات متناسب با حجم آیات، میزان دشواری نشانه‌های خطی (مانند الف کوچک، سکون، تشدید و تنوین‌ها) و تکرارپذیری عبارات تنظیم شود؛ به‌طوری‌که برای آموزش اتصالات حروف و تقطیع هجاها زمان و صبوری بیشتری صرف شده و از شتاب‌زدگی برای رسیدن به روان‌خوانی کامل در یک جلسه پرهیز گردد. این طرح درس برای 30 هفته آموزشی تدوین شده است. معلمان گرامی می‌توانند با توجه به تفاوت‌های فردی دانش‌آموزان در مهارت‌های شنیداری و خوانداری، شرایط اقلیمی، مناسبت‌های مذهبی و ملی (جشن شکوفایی قرآن در مهر، هفته قرآن و عترت، ایام ماه مبارک رمضان، اعیاد اسلامی و دهه فجر) و برنامه‌های مدرسه، انعطاف لازم را در بودجه‌بندی اعمال کرده و فرصت‌های ترمیمی و تثبیتی مناسبی فراهم آورند.